26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3743 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  91.37 
 
 		 296 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  90.29 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  84.12 
 
 		 296 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  60 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  50.53 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  49.6 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  36.02 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  35.67 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  34.64 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  27.11 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  26.95 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  29.31 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  26.74 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  23.89 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  29.91 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  27.16 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  27.59 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  27.93 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  27.35 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  27.83 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  25.86 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.21 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>