19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4210 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  62.76 
 
 		 296 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  61.73 
 
 		 296 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  61.37 
 
 		 296 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  61.37 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  47.08 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  48.48 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  33.85 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  32.2 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  35.67 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  31.35 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  34.64 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  25.27 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  32.79 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  24.06 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  25.43 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  23.46 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.07 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>