14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3001 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  23.18 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  25.27 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  23.91 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  25.84 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  26.9 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  26.35 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  25.75 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  25.75 
 
 
296 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  26.35 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  23.68 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  21.43 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  19.83 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  22.99 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>