18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0509 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 325 aa  617  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  27.51 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  34.03 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  30.99 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  32.98 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  35.16 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  30.69 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  30.13 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  20.65 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.88 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  20.23 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  26.79 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  31.21 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.92 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>