118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0882 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  64.66 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  44.78 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  41.34 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  46.07 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  41.88 
 
 		 336 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  40.62 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  42.91 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  42.97 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  40.07 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  40.38 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  41.95 
 
 		 282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  42.38 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  29.73 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  26.29 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.29 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  28.43 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  28.78 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  27.59 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  25.82 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  25.66 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  27.59 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  29.67 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  27 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.92 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.32 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  26.69 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  26.72 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  28.02 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.72 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.72 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.72 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.72 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.72 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  26.09 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  28.71 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  26.69 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  29.13 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.16 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  26.09 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  27.07 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.29 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  29.21 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  26.57 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  25.24 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  27.18 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.89 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  24.26 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  24.26 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  25.24 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  26.21 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.25 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  25.5 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  27.48 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.84 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  25.12 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  24.24 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  27.32 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  27.71 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  26.7 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  26.36 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  24.64 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.77 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  24.15 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.95 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.4 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  27.19 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.37 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  21.65 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  28.5 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  26.6 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  27.36 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.88 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  24.88 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  30.87 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  23.3 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  24.15 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  29.41 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  26.92 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  23.16 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  27.96 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.17 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.52 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  27.43 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.88 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26.07 
 
 		 640 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  25.41 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.19 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  22.32 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  20.87 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>