72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1359 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  60.07 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  49.82 
 
 
298 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  46.74 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  43.4 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  43.28 
 
 
283 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  43.51 
 
 
282 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  41.98 
 
 
282 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  40.99 
 
 
287 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  37.08 
 
 
297 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  40.58 
 
 
290 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  34.52 
 
 
336 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  32.81 
 
 
298 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  27.01 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.31 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  27.07 
 
 
322 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.64 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  28.41 
 
 
323 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  26.88 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.57 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.86 
 
 
325 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.97 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  24.24 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.7 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  29.25 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  25.76 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  24.15 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  23.23 
 
 
321 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.4 
 
 
319 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  22.28 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.43 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  24.77 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  27.93 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.45 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1270  hypothetical protein  21.88 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.24 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  21.86 
 
 
584 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  24.55 
 
 
322 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.23 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  25.19 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26.19 
 
 
640 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.23 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  24.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  27.84 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  24.77 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  25 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  24.86 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  24.09 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.77 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.81 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  22.47 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  21.23 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.32 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  21.4 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  24.32 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  22.29 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  22.86 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  24.16 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  21.4 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.81 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.73 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>