26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1270 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1270  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  21.88 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  21.92 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.06 
 
 
298 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  23.28 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.87 
 
 
325 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  26.63 
 
 
317 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  26.92 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.27 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  24.17 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.35 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  22.22 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.74 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.71 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.5 
 
 
329 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  21.67 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  23.61 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  24.5 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  22.32 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  24.55 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  22.92 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  22.58 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  23.08 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  23.36 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  23.08 
 
 
336 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  22.02 
 
 
320 aa  42.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>