More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2483 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  76.27 
 
 		 414 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 414 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  50.38 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  50.38 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  43.32 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  41.92 
 
 		 396 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  41.92 
 
 		 396 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  44.3 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  42.96 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  42.68 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  41.88 
 
 		 396 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  41.41 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  44.05 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  41.83 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  37 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  40.46 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  41.65 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 536 aa  252  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  38.97 
 
 		 935 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  36.32 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  38.6 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 410 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 435 aa  199  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.41 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  31.49 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  29.35 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  29.62 
 
 		 384 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 429 aa  139  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  29 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  30.23 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 457 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.26 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  29.69 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 		 423 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  29 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.69 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.46 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  30.49 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.55 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.62 
 
 		 351 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>