More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2074 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  100 
 
 		 479 aa  976    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  44.84 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  43.79 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  43.68 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  42.18 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  41.69 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  35.57 
 
 		 495 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  35.57 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  37.5 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  36.91 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  35.25 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  42.25 
 
 		 427 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  35.9 
 
 		 463 aa  249  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  32.56 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  32.39 
 
 		 1199 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  29.52 
 
 		 628 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  34.94 
 
 		 1274 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  31.56 
 
 		 433 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.72 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.02 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  31.6 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  27.59 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  32.68 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.69 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  29.69 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  32.35 
 
 		 999 aa  126  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  29.24 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  26.31 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  29.81 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  29.86 
 
 		 420 aa  123  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  27.25 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  31.59 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  27.92 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  30.09 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  28.26 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  28.19 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  31.99 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  27.71 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  29.98 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  28.13 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  29.42 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.97 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  28.99 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  30.24 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.54 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  28.37 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  28.13 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.1 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.68 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  29.14 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  29.31 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.91 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  28.7 
 
 		 442 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  29.06 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.62 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  28.81 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  24.44 
 
 		 577 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  27.78 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  27.31 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.32 
 
 		 625 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.01 
 
 		 496 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.56 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.66 
 
 		 624 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  27.73 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.56 
 
 		 600 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.21 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.21 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.72 
 
 		 592 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  28.92 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.83 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.19 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.76 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  27.29 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.96 
 
 		 459 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.56 
 
 		 457 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.17 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.89 
 
 		 565 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.34 
 
 		 616 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.14 
 
 		 619 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  27.68 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.04 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  24.51 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  25.82 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.6 
 
 		 454 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  27.07 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  27.08 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  26.99 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  26.54 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.51 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.23 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  24.88 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  26.37 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  26.75 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>