More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1273 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.06 
 
 
556 aa  872    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
556 aa  1124    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
542 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
718 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
509 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
906 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
701 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  37.74 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  37.36 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
498 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  37.64 
 
 
461 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  38.15 
 
 
397 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
905 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
884 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
625 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
695 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
581 aa  156  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
725 aa  156  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 
508 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  35.47 
 
 
464 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
641 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
640 aa  153  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
911 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
880 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
1171 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
430 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
639 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
592 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
695 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
873 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
899 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
875 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
944 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1064 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
639 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
705 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
689 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
639 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
894 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
887 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1042 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
531 aa  146  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
614 aa  146  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
899 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
613 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
919 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
637 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
592 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
893 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1048 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
1039 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
1010 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
421 aa  144  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
984 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
670 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
614 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
933 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1120  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
577 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  33.21 
 
 
932 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1002 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
697 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
726 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
392 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
668 aa  141  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  34 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  26.49 
 
 
736 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1155 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
754 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2135  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
576 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1131 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
841 aa  140  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
1319 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
1385 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2091  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
563 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.85 
 
 
948 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.21 
 
 
560 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
1009 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
612 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  34.87 
 
 
919 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
691 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  35.04 
 
 
1161 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
396 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
1390 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
694 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.21 
 
 
929 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
608 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
815 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
1390 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
691 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
885 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1287 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  32.69 
 
 
576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1977 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
3470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>