75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0258 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 329 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  62.94 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  60.13 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 317 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  51.95 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  51.13 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  53.8 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  51.94 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 342 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  48.91 
 
 		 316 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  49.17 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.55 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  26.53 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.09 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  21.2 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.12 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 268 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.86 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  28.95 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.88 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.48 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 371 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  27.32 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  24.4 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  30.82 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.9 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 252 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  39.71 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>