More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3078 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  95.4 
 
 		 413 aa  799    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 413 aa  830    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  85.5 
 
 		 409 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  70.18 
 
 		 394 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  40.68 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  41.39 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  42.22 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  40.59 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  41.42 
 
 		 409 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  40.31 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  39.39 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  39.39 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  38.64 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  39.32 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  40 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  38.5 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  39.19 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  36.68 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  34.75 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  37.8 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  37.5 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.34 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  36.09 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  36.58 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.05 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  33.51 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  34.66 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  33.42 
 
 		 409 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.94 
 
 		 374 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  32.46 
 
 		 374 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  34.65 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.15 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.44 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.15 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  34.7 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.64 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  34.69 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  32.53 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  33.6 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  28.39 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.51 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.92 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.5 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  32.3 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.93 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  31.89 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  31.89 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  29.81 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  30.46 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  30.81 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  31.12 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.08 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  34.29 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.08 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  33.61 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  31.7 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  30.47 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.51 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.26 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  31.18 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.27 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  32.71 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.08 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.61 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.52 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  30.09 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  29 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  32.06 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.74 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  29.11 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  31.71 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.83 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  32.69 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  32.91 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.39 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  27.16 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  28.22 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  31.51 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  29.72 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  27.72 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.18 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28.61 
 
 		 436 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.96 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  27.51 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.77 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.64 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  26.44 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  28.41 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  27.64 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.3 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  29.66 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  27.32 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  27.51 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  25 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  31.71 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  26.29 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  26.84 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>