More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2128 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  582  1e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  98.61 
 
 
288 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  75.95 
 
 
292 aa  440  1e-122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  71.13 
 
 
292 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  69.76 
 
 
292 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  69.76 
 
 
292 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  69.42 
 
 
311 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  66.1 
 
 
292 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  65.07 
 
 
292 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  54.21 
 
 
295 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  48.16 
 
 
294 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  51.41 
 
 
288 aa  239  3e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  51.06 
 
 
288 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  43.16 
 
 
311 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  41.13 
 
 
315 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 
314 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
313 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  38.65 
 
 
317 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  39.36 
 
 
310 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  38.73 
 
 
316 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  36.1 
 
 
300 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  43.62 
 
 
310 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 
325 aa  173  2e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  35.96 
 
 
310 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  36.3 
 
 
320 aa  165  1e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  34.75 
 
 
301 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  34.62 
 
 
289 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  36.62 
 
 
295 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  37.55 
 
 
295 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  35.13 
 
 
294 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 
339 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  37.18 
 
 
331 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.92 
 
 
295 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  34.8 
 
 
304 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  34.74 
 
 
301 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  37.82 
 
 
347 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.82 
 
 
333 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  34.05 
 
 
294 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  34.05 
 
 
294 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  34.11 
 
 
309 aa  148  1e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  32 
 
 
319 aa  148  1e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
293 aa  147  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  34.04 
 
 
313 aa  146  4e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  7.53467e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  146  4e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  37.02 
 
 
317 aa  145  8e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  38.49 
 
 
281 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  34.16 
 
 
293 aa  141  1e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  35.43 
 
 
309 aa  141  1e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 
306 aa  141  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 
318 aa  141  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 
293 aa  140  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  37.13 
 
 
306 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
292 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.11 
 
 
312 aa  136  3e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  35.62 
 
 
297 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.7 
 
 
317 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  32.5 
 
 
308 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  36.64 
 
 
308 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  32.39 
 
 
295 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  32.87 
 
 
295 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.8 
 
 
301 aa  129  4e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  128  9e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  33.57 
 
 
289 aa  125  8e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.82 
 
 
333 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 
308 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.93 
 
 
299 aa  122  1e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  31.44 
 
 
305 aa  121  2e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.34 
 
 
291 aa  120  2e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.52 
 
 
309 aa  120  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.97 
 
 
309 aa  120  4e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.37 
 
 
314 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  30 
 
 
342 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  29.18 
 
 
304 aa  114  2e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 
289 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  32.16 
 
 
307 aa  111  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  33.68 
 
 
299 aa  110  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.18 
 
 
317 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
318 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.85 
 
 
301 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.57 
 
 
324 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  33.45 
 
 
307 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.62 
 
 
331 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.05 
 
 
319 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.74 
 
 
318 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  33.1 
 
 
307 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
305 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  29.93 
 
 
300 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
305 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  32.65 
 
 
296 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.41 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  30.38 
 
 
294 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.49 
 
 
302 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.88 
 
 
305 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
318 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  31.25 
 
 
298 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  30.9 
 
 
300 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>