More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1871 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
281 aa  575  1e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  61.21 
 
 
305 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  55.51 
 
 
273 aa  273  2e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  50.36 
 
 
297 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 
297 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  52.76 
 
 
328 aa  147  1e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 
218 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  55.46 
 
 
196 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.7 
 
 
207 aa  140  2e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 
304 aa  138  8e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 
211 aa  136  3e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  46.56 
 
 
261 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  34.91 
 
 
202 aa  131  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  48.82 
 
 
206 aa  130  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 
263 aa  130  2e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 
280 aa  129  5e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  47.58 
 
 
217 aa  129  7e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  45.32 
 
 
247 aa  128  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.94 
 
 
204 aa  128  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.32 
 
 
217 aa  127  2e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 
234 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 
244 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 
189 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50.4 
 
 
198 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
217 aa  125  8e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 
239 aa  125  8e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.17 
 
 
226 aa  125  8e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 
239 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 
239 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 
208 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  46.38 
 
 
245 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.38 
 
 
239 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35.48 
 
 
204 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 
237 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  45.32 
 
 
251 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  45.32 
 
 
251 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  46.38 
 
 
249 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 
299 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
206 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  46.32 
 
 
442 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  45.32 
 
 
251 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 
243 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 
281 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  49.57 
 
 
203 aa  121  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 
300 aa  120  2e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  51.79 
 
 
228 aa  120  2e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.78 
 
 
318 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
238 aa  120  4e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.77614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  45.38 
 
 
261 aa  119  5e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
282 aa  119  5e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  46.15 
 
 
261 aa  119  5e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  45.38 
 
 
261 aa  119  5e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 
256 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  45.38 
 
 
261 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  45.38 
 
 
261 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  45.38 
 
 
261 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  46.77 
 
 
326 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45.38 
 
 
259 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 
216 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  46.15 
 
 
261 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 
261 aa  119  8e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
212 aa  118  1e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45.38 
 
 
261 aa  118  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  46.51 
 
 
208 aa  117  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 
235 aa  117  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  33.18 
 
 
362 aa  117  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
260 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 
299 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  49.53 
 
 
332 aa  115  8e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 
368 aa  114  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.56 
 
 
198 aa  115  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  2.86118e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  43.9 
 
 
174 aa  114  2e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35.07 
 
 
204 aa  114  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  36.57 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.6 
 
 
438 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 
233 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  48.21 
 
 
362 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 
283 aa  113  4e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.73 
 
 
241 aa  113  4e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  47.54 
 
 
293 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  30.74 
 
 
199 aa  112  7e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.46 
 
 
291 aa  112  7e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 
272 aa  112  7e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  45.97 
 
 
258 aa  111  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 
327 aa  112  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.22 
 
 
199 aa  111  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 
194 aa  110  2e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.54 
 
 
222 aa  110  2e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  42.65 
 
 
146 aa  111  2e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  47.79 
 
 
201 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  43.33 
 
 
188 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  38.65 
 
 
271 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  45.04 
 
 
300 aa  108  7e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 
282 aa  108  8e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  45.04 
 
 
292 aa  108  8e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.72 
 
 
196 aa  108  8e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
329 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 
195 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1601  Lytic transglycosylase catalytic  50.91 
 
 
321 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 
251 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>