More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1601 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1601  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 321 aa  646    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  56.34 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  56.18 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  42.69 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  58.04 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  55 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  56.88 
 
 		 218 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  58.04 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  48.36 
 
 		 206 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.55 
 
 		 199 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.57 
 
 		 189 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  49.14 
 
 		 202 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  44.63 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 196 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 206 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  58.56 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  47.58 
 
 		 217 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  55.77 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 203 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 212 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  50.91 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.95 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45.6 
 
 		 204 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.11 
 
 		 217 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  48.28 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  47.97 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  46.77 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  56.73 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  44.8 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  56.73 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  55.77 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.92 
 
 		 146 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  46.77 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  43.7 
 
 		 174 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  42.58 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  47.75 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 		 239 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  45.38 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 233 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 258 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.67 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  40.44 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  43.55 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  42.07 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  40.99 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  44.6 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 211 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  45.6 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.48 
 
 		 198 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 194 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  49.07 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 222 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  45.67 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  45.67 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 208 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  46.22 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  51.89 
 
 		 203 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  43.55 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 210 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  44.29 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 200 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.37 
 
 		 226 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 		 215 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  37.16 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  44.86 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  34.08 
 
 		 215 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  42.74 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 194 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  51.38 
 
 		 215 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 204 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>