More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0993 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 345 aa  712    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  47.51 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  42.44 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  35.56 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  35.19 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  33.23 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 296 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.21 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.41 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.58 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 286 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.96 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.93 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  32 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.36 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.98 
 
 		 263 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 287 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.21 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.21 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.41 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 462 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 283 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.34 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.02 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>