More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5282 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 309 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  85.25 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  85.25 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  84.59 
 
 		 307 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  84.59 
 
 		 307 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  84.59 
 
 		 307 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  78.5 
 
 		 308 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  75.83 
 
 		 309 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  73.6 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  72.82 
 
 		 308 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  73.84 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  67.55 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  66.23 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  36.3 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.17 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  38.74 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  38.74 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  37.42 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  29.32 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.7 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  31.11 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  30.35 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  26 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.54 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  27.88 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  28.3 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  25.9 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  26.98 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>