More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1878 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  88.95 
 
 		 168 aa  306  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  67.32 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 284 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  67.32 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  66.01 
 
 		 275 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  65.36 
 
 		 180 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  65.36 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  63.35 
 
 		 181 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  61.49 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  63.4 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  62.09 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  63.64 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  62.09 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  63.64 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  62.66 
 
 		 186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  64.97 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  62.03 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  62.99 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  60.78 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  64.71 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 181 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  59.74 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  59.09 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  56.4 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  63.06 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  65.15 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  58.82 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  53.5 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 164 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  47.95 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  48.52 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.52 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.53 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  49.69 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  47.93 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  47.78 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  47.22 
 
 		 194 aa  151  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 174 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  47.34 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  51.22 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.88 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  49.38 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  46.02 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.28 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  48.7 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  53.85 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  44.94 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.09 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.37 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  52.53 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  51.68 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.93 
 
 		 133 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  45.18 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  50.91 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  52.99 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>