More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2721 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  69.92 
 
 		 180 aa  191  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  63.16 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 275 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 284 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  62.86 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  62.14 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  62.77 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  62.77 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  62.77 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  61.43 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  59.29 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  61.31 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  59.29 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  61.43 
 
 		 181 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  61.43 
 
 		 181 aa  163  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  57.86 
 
 		 181 aa  163  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  61.31 
 
 		 180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  57.86 
 
 		 181 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  57.86 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  66.12 
 
 		 183 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 180 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  69.17 
 
 		 171 aa  153  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  65.41 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  64.29 
 
 		 184 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  63.16 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  59.35 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  63.16 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  60.16 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  59.35 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  59.35 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  60.53 
 
 		 182 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  58.93 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  59.63 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  56.14 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  61.61 
 
 		 176 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  53.66 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  59.82 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.16 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  56.2 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  56.52 
 
 		 164 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 173 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  56 
 
 		 194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  56.25 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  55.2 
 
 		 194 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  57.02 
 
 		 173 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  57.02 
 
 		 173 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  54.4 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  57.02 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  56.2 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.15 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  51.67 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  57.8 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  50.38 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  57.8 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 173 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 173 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 173 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 173 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  49.62 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  55.93 
 
 		 173 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.71 
 
 		 175 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  56.88 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  53.49 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  56.88 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  55.05 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  55.3 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  53.57 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  51.82 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  56.88 
 
 		 204 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  55.36 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  55.36 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.39 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  59.82 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  59.82 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  47.41 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  59.82 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.27 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  50.45 
 
 		 182 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  44.25 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.29 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.67 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  59.46 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  59.46 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.78 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  58.04 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>