More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0392 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  62.17 
 
 		 618 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.38 
 
 		 645 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.34 
 
 		 633 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.47 
 
 		 623 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.08 
 
 		 617 aa  687    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.21 
 
 		 618 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75 
 
 		 615 aa  883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  75.04 
 
 		 627 aa  905    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  63.33 
 
 		 615 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 618 aa  1238    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.75 
 
 		 635 aa  748    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  62.88 
 
 		 621 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  83.31 
 
 		 616 aa  1007    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.42 
 
 		 610 aa  782    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  75.66 
 
 		 605 aa  909    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  83.42 
 
 		 609 aa  1016    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.17 
 
 		 605 aa  909    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  64.41 
 
 		 616 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.21 
 
 		 618 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.88 
 
 		 624 aa  902    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  61.34 
 
 		 617 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.87 
 
 		 607 aa  698    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.3 
 
 		 607 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  65.4 
 
 		 630 aa  794    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.64 
 
 		 610 aa  760    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  55.68 
 
 		 635 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.91 
 
 		 696 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.91 
 
 		 714 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 		 647 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.64 
 
 		 615 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  52.67 
 
 		 646 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 		 646 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 		 646 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.62 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.62 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  55.22 
 
 		 645 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 		 645 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  51.04 
 
 		 627 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.92 
 
 		 625 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  53.94 
 
 		 623 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.22 
 
 		 623 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 		 655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 658 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  50.74 
 
 		 692 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  50.24 
 
 		 621 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 		 655 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 		 630 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 		 706 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.65 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 687 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  49.35 
 
 		 624 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.25 
 
 		 608 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 705 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  50.17 
 
 		 620 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 658 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 		 653 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 		 697 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  50.16 
 
 		 619 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.93 
 
 		 645 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  51.08 
 
 		 625 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.03 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  53.25 
 
 		 637 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.77 
 
 		 607 aa  545  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  50.59 
 
 		 616 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  50.25 
 
 		 659 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.5 
 
 		 673 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 		 621 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  50.33 
 
 		 620 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.43 
 
 		 706 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.31 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.31 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  46.77 
 
 		 694 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  49.83 
 
 		 620 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.16 
 
 		 612 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.16 
 
 		 612 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  51.82 
 
 		 620 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  48.52 
 
 		 648 aa  538  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  49.19 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  50.42 
 
 		 626 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  55.38 
 
 		 917 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  47.52 
 
 		 699 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.38 
 
 		 852 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  50.99 
 
 		 624 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.38 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.62 
 
 		 714 aa  535  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.55 
 
 		 652 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  48.26 
 
 		 641 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47 
 
 		 686 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 641 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 681 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 		 667 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>