172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1824 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1824  GrpE protein  100 
 
 
234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.311455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  36.75 
 
 
172 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.94 
 
 
172 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  37.42 
 
 
183 aa  85.1  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  31.5 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.4 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  29.45 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  29.55 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  23.91 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  28.04 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  26.46 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  28.93 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  28.86 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  24.69 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  25 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.04 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  28.76 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  26.25 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  27.6 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  21.38 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  25.17 
 
 
197 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  26.16 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  22.15 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  24.32 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  29.94 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  26.45 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  28.47 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  23.98 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  26.47 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  27.16 
 
 
175 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 
195 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  20.39 
 
 
188 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  23.03 
 
 
179 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  27.53 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  21.48 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  26.56 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  27.08 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  25 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  23.88 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  26.32 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  21.48 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  27.78 
 
 
410 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  26.15 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  26.47 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  26.56 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  22.39 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  27.33 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  21.05 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  26.32 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  27.61 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  24.78 
 
 
361 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  25.74 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  26.67 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  22.94 
 
 
172 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  23.43 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  21.48 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  28.91 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  25.13 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  37.29 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  30.61 
 
 
182 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  26.4 
 
 
286 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  26.15 
 
 
192 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  25.76 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  24.6 
 
 
190 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  27.53 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  27.13 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  25.76 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  27.13 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf619  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  27.69 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  26.5 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  27.56 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  25.99 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  26.98 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  23.29 
 
 
171 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  29 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  28.74 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  23.2 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  26.62 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  26.47 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  26.98 
 
 
186 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  26.83 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  22.09 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  26.19 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  24.84 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  23.4 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  25.14 
 
 
222 aa  47  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  24.6 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  24.74 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  24.71 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  24.6 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  24.6 
 
 
197 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  26.06 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  20.8 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>