More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3842 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  61.14 
 
 		 1103 aa  1247    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  57.36 
 
 		 1097 aa  1132    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  59.16 
 
 		 1094 aa  1339    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  61.14 
 
 		 1103 aa  1286    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  61.66 
 
 		 1112 aa  1239    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  55.42 
 
 		 1105 aa  1103    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 1090 aa  2195    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  57.99 
 
 		 1102 aa  1249    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  60.16 
 
 		 610 aa  692    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  48.45 
 
 		 1033 aa  953    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  59.53 
 
 		 1102 aa  1264    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  55.94 
 
 		 1126 aa  1112    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  55.72 
 
 		 1152 aa  1087    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  62.66 
 
 		 602 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  52.87 
 
 		 1054 aa  964    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.76 
 
 		 1091 aa  1278    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  76.19 
 
 		 1095 aa  1593    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  56.7 
 
 		 1067 aa  1107    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  61.73 
 
 		 519 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.35 
 
 		 1098 aa  1197    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  75 
 
 		 1095 aa  1572    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  58.82 
 
 		 1103 aa  1250    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  58.22 
 
 		 1097 aa  1106    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  54.83 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  47.39 
 
 		 600 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  54.4 
 
 		 503 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  54.21 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  54.21 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  52.49 
 
 		 519 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  54.01 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  43.93 
 
 		 1147 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  44.44 
 
 		 1147 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1149 aa  386  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  45.77 
 
 		 1146 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  44.54 
 
 		 1137 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.16 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  45.58 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  45.45 
 
 		 471 aa  383  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  45.09 
 
 		 1148 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0622  biotin carboxylase-like  41.94 
 
 		 485 aa  383  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  45.09 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  42.83 
 
 		 1144 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.17 
 
 		 448 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40.67 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  39.13 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.95 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.92 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  42.95 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  44.66 
 
 		 1148 aa  380  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  43.71 
 
 		 1150 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  43.51 
 
 		 1252 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  43.71 
 
 		 1150 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  42.89 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  43.56 
 
 		 1147 aa  376  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  42.79 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  42.79 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.27 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.23 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  46.34 
 
 		 1165 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.15 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.44 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 		 1148 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  46.04 
 
 		 1196 aa  373  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  45.23 
 
 		 1147 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1619  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  40.41 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  41.92 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  42.08 
 
 		 1103 aa  373  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  44.49 
 
 		 1145 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  42.44 
 
 		 1148 aa  373  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6396  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40.4 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.51 
 
 		 447 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.35 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1426  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.01 
 
 		 449 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0792  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  40.28 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21160  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  39.32 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.127791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.77 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4175  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  39.15 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.62 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0779  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.52 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4784  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  38.44 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  41.39 
 
 		 1150 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1325  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  37.83 
 
 		 602 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.24 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1289  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 602 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1306  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  37.83 
 
 		 602 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0707012  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  43.48 
 
 		 1264 aa  366  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.46 
 
 		 448 aa  366  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5726  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.83 
 
 		 575 aa  366  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.835782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2274  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.15 
 
 		 459 aa  365  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  39.73 
 
 		 591 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3798  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  41.7 
 
 		 583 aa  366  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2127  acetyl-CoA carboxylase/biotin carboxylase  46.34 
 
 		 445 aa  365  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  44.03 
 
 		 448 aa  365  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90975  Pyruvate carboxylase  44.81 
 
 		 1179 aa  364  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301663  normal  0.518395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05230  biotin carboxylase /acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  46.81 
 
 		 450 aa  364  5.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>