More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2350 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  50.49 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  48.8 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  56.85 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  51.2 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  47.78 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  48.34 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  46.38 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  46.84 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  46.84 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  46 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  45.63 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  45.02 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  49.26 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  48.77 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  45.5 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  47.06 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  46.38 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  48.56 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  46 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  44.28 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  46.04 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  45.27 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  42.71 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  42.71 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  42.71 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  42.71 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  42.71 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  42.71 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  42.19 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  42.19 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  42.19 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  39.02 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  46 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  45.18 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  43.68 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  43.68 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  48.76 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  48.76 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  48.76 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  48.76 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  48.76 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  42.11 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  42.86 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  41.58 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  41.58 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  40.1 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  42.29 
 
 		 246 aa  147  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  40.67 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  40.31 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  37.25 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  43.75 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39.2 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.2 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  50.25 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  42.21 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  40 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  47.06 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  39.59 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  38.54 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  37.56 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  39.46 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  37.88 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  45.92 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  39.39 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  41.24 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  37.69 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  40.69 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  42.49 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  45 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  36.79 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  35.57 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  39.9 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36.41 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>