More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0010 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  55.19 
 
 
634 aa  660  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  58.2 
 
 
825 aa  653  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46448e-06 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.31 
 
 
636 aa  703  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.64 
 
 
635 aa  689  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.93 
 
 
633 aa  724  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
640 aa  717  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.31 
 
 
641 aa  636  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  56.21 
 
 
642 aa  681  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.77 
 
 
658 aa  667  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  56.79 
 
 
637 aa  696  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  58.78 
 
 
640 aa  772  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  89.13 
 
 
643 aa  1201  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  61.17 
 
 
802 aa  685  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.22 
 
 
641 aa  639  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 
640 aa  712  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  59.62 
 
 
635 aa  727  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 
640 aa  711  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  60.89 
 
 
796 aa  667  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  60.26 
 
 
786 aa  656  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  88.91 
 
 
649 aa  1201  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  85.25 
 
 
644 aa  1159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  85.56 
 
 
644 aa  1164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  54.47 
 
 
650 aa  659  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.02 
 
 
654 aa  638  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.27299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  59.35 
 
 
651 aa  771  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 
656 aa  672  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.56 
 
 
641 aa  741  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 
651 aa  679  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.43 
 
 
655 aa  657  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 
655 aa  657  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  52.27 
 
 
655 aa  667  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  52.35 
 
 
655 aa  655  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  88.98 
 
 
643 aa  1191  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  52.35 
 
 
655 aa  660  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.54 
 
 
638 aa  713  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  60.22 
 
 
646 aa  763  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.27 
 
 
640 aa  710  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 
640 aa  646  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  56.69 
 
 
627 aa  697  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.47 
 
 
645 aa  638  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.51 
 
 
649 aa  637  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 
640 aa  646  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.84 
 
 
636 aa  701  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.11 
 
 
794 aa  664  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.17 
 
 
642 aa  683  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  61.54 
 
 
802 aa  684  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
645 aa  762  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  61.65 
 
 
649 aa  793  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  52.36 
 
 
645 aa  635  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  59.44 
 
 
640 aa  724  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  59.03 
 
 
636 aa  703  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  60.98 
 
 
635 aa  728  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  52.93 
 
 
648 aa  665  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 
647 aa  653  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  55.23 
 
 
641 aa  684  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 
633 aa  664  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  51.95 
 
 
660 aa  641  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  55.04 
 
 
642 aa  688  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  58.1 
 
 
636 aa  753  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  52.71 
 
 
645 aa  637  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 
647 aa  644  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  55.62 
 
 
637 aa  716  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  54.45 
 
 
644 aa  677  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  52.94 
 
 
643 aa  660  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  54.25 
 
 
644 aa  674  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  57.93 
 
 
666 aa  726  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  54.89 
 
 
642 aa  685  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.27 
 
 
640 aa  730  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.73 
 
 
645 aa  671  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 
648 aa  655  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.62 
 
 
645 aa  665  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 
637 aa  693  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.48 
 
 
642 aa  723  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  57.68 
 
 
642 aa  699  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.52 
 
 
645 aa  649  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 
665 aa  653  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 
636 aa  659  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.46 
 
 
644 aa  734  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 
640 aa  711  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  56.99 
 
 
650 aa  741  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.97 
 
 
640 aa  717  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  60.7 
 
 
796 aa  667  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  59.79 
 
 
658 aa  762  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  55.22 
 
 
641 aa  639  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  53.21 
 
 
654 aa  669  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  54.47 
 
 
637 aa  680  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  58.27 
 
 
659 aa  759  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
661 aa  638  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 
657 aa  642  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  61.34 
 
 
652 aa  772  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  57.48 
 
 
651 aa  727  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.97 
 
 
640 aa  716  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 
643 aa  659  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  89.31 
 
 
637 aa  1179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.2 
 
 
655 aa  646  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.23 
 
 
634 aa  706  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  3.28066e-10  unclonable  1.30354e-08 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.55 
 
 
795 aa  662  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 
640 aa  711  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.3 
 
 
655 aa  659  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.71 
 
 
651 aa  687  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>