More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1757 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
391 aa  808    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  73.26 
 
 
388 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  72.75 
 
 
388 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 
389 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  71.5 
 
 
389 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  71.72 
 
 
388 aa  564  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  70.33 
 
 
391 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  67.27 
 
 
390 aa  554  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  70.03 
 
 
382 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  69.25 
 
 
382 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  68.99 
 
 
382 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  70.44 
 
 
387 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  69.51 
 
 
382 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
395 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  68.73 
 
 
385 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  46.15 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  44.47 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  43.16 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.29 
 
 
393 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  41.24 
 
 
390 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  45.98 
 
 
381 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  44.03 
 
 
390 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.03 
 
 
383 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  41.6 
 
 
380 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  40.51 
 
 
383 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  42.31 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.82 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  40.51 
 
 
383 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.74 
 
 
382 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  40.76 
 
 
402 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  43.17 
 
 
384 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  39.75 
 
 
385 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  40.76 
 
 
402 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.64 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  42.55 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  39.78 
 
 
379 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  40.61 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.3 
 
 
379 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  38.98 
 
 
379 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.93 
 
 
388 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  38.36 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  37.9 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  41.95 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  39.08 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.67 
 
 
382 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  36.81 
 
 
388 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.53 
 
 
380 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.31 
 
 
402 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.31 
 
 
402 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.31 
 
 
402 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32 
 
 
403 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.06 
 
 
389 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 
388 aa  176  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.45 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.25 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.16 
 
 
389 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.16 
 
 
389 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.79 
 
 
388 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.79 
 
 
388 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.79 
 
 
388 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.79 
 
 
387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  35.43 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.09 
 
 
386 aa  163  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.37 
 
 
387 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.46 
 
 
394 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.59 
 
 
390 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 
388 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.29 
 
 
404 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.91 
 
 
391 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  31.49 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.27 
 
 
387 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 
387 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.38 
 
 
392 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.99 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.73 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.1 
 
 
388 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  35.68 
 
 
402 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.06 
 
 
378 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.11 
 
 
404 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.3 
 
 
394 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.07 
 
 
388 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.67 
 
 
390 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.44 
 
 
392 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.07 
 
 
388 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.79 
 
 
388 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.07 
 
 
388 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.07 
 
 
388 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.5 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.05 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.42 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.79 
 
 
388 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.79 
 
 
388 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.79 
 
 
388 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.79 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.73 
 
 
389 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.6 
 
 
394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.44 
 
 
387 aa  145  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>