More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0627 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  100 
 
 
627 aa  1266    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  47.35 
 
 
596 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.81 
 
 
582 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  43.35 
 
 
605 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.75 
 
 
585 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40 
 
 
572 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 
571 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  39.86 
 
 
624 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  39.69 
 
 
579 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.24 
 
 
577 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.97 
 
 
600 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  44.59 
 
 
579 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  39.59 
 
 
589 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  44.01 
 
 
611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.3 
 
 
583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.43 
 
 
580 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 
571 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  40.64 
 
 
588 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.7 
 
 
596 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.97 
 
 
580 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.87 
 
 
574 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.87 
 
 
574 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.46 
 
 
590 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.52 
 
 
609 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  37.54 
 
 
609 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.67 
 
 
602 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  43.11 
 
 
611 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  42.56 
 
 
586 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  43.33 
 
 
596 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.75 
 
 
588 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  42.14 
 
 
611 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 
592 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  43.18 
 
 
597 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.54 
 
 
591 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 
611 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
598 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  43.18 
 
 
597 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.24 
 
 
581 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  40.24 
 
 
598 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.3 
 
 
579 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  38.7 
 
 
601 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.93 
 
 
579 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.37 
 
 
590 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.8 
 
 
587 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  37.87 
 
 
601 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.93 
 
 
587 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2763  transport ATP-binding protein msbA  40.9 
 
 
590 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.714351  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.48 
 
 
594 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  37.39 
 
 
601 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.36 
 
 
597 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.66 
 
 
596 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.48 
 
 
618 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.96 
 
 
594 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.38 
 
 
585 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  39.34 
 
 
605 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  38 
 
 
595 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.38 
 
 
596 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.88 
 
 
598 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.81 
 
 
582 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.58 
 
 
574 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.58 
 
 
575 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.58 
 
 
575 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.81 
 
 
582 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.58 
 
 
575 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.41 
 
 
583 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.58 
 
 
574 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  37.72 
 
 
612 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.81 
 
 
582 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.38 
 
 
596 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.38 
 
 
596 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.93 
 
 
587 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.24 
 
 
586 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  37.54 
 
 
595 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.62 
 
 
583 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.81 
 
 
606 aa  364  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.62 
 
 
623 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  40.89 
 
 
597 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.62 
 
 
583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
634 aa  363  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.62 
 
 
593 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.52 
 
 
582 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.44 
 
 
597 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.05 
 
 
601 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.28 
 
 
593 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.28 
 
 
583 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.4 
 
 
606 aa  359  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  35.31 
 
 
588 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 
582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  38.88 
 
 
623 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  38.46 
 
 
607 aa  356  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.94 
 
 
583 aa  356  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.54 
 
 
586 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  38.51 
 
 
649 aa  356  8.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
581 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  34.28 
 
 
593 aa  355  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  39.26 
 
 
600 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>