More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0558 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 584 aa  1192    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  55.38 
 
 		 591 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  54.1 
 
 		 601 aa  628  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  55.87 
 
 		 582 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  52.03 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  51.86 
 
 		 553 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  52.72 
 
 		 551 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  51.68 
 
 		 570 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 590 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  51.49 
 
 		 602 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 		 574 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 		 571 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  37.91 
 
 		 644 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 569 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 570 aa  356  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 565 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 578 aa  326  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 518 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 770 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 		 514 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 521 aa  293  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 527 aa  291  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 525 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 523 aa  290  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 523 aa  290  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 509 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 539 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 499 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 536 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 526 aa  283  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 640 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 518 aa  280  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 518 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 510 aa  277  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.35 
 
 		 531 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 508 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.83 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.76 
 
 		 582 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 532 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 545 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 518 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.7 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.64 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 		 563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  34.43 
 
 		 544 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 546 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.29 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 549 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 		 561 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 530 aa  270  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 500 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 525 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.21 
 
 		 500 aa  269  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.83 
 
 		 561 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 508 aa  267  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 544 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.22 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 		 582 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 501 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.76 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.76 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 559 aa  266  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 556 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 556 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 556 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>