More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2955 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  56.83 
 
 
829 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
818 aa  1687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.92 
 
 
911 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  30.93 
 
 
954 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  30.8 
 
 
954 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  30.93 
 
 
954 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  29.74 
 
 
873 aa  310  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  29.34 
 
 
991 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  30.12 
 
 
945 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  30.12 
 
 
945 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  30.46 
 
 
946 aa  300  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  32.62 
 
 
921 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  29.79 
 
 
931 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.79 
 
 
931 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  29.55 
 
 
962 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.55 
 
 
962 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  27.15 
 
 
928 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  27.15 
 
 
961 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  28.55 
 
 
916 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  26.62 
 
 
963 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.24 
 
 
366 aa  99  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  23.44 
 
 
479 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  25.1 
 
 
314 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  21.68 
 
 
1667 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.65 
 
 
354 aa  89  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.07 
 
 
311 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.41 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.93 
 
 
752 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.77 
 
 
1094 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  22.94 
 
 
580 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.78 
 
 
689 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.64 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.25 
 
 
328 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.91 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.78 
 
 
330 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.43 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.03 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.92 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
366 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  21.4 
 
 
776 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  24.56 
 
 
335 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.91 
 
 
336 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.25 
 
 
328 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.65 
 
 
366 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.25 
 
 
327 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.54 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.78 
 
 
317 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.29 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.61 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.51 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  22.65 
 
 
819 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  23.61 
 
 
971 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.93 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.1 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.53 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  22.61 
 
 
1189 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  21.91 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.03 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.81 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.05 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  22.53 
 
 
810 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.27 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.97 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.89 
 
 
362 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.17 
 
 
327 aa  73.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.75 
 
 
347 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  25.31 
 
 
250 aa  73.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  26.07 
 
 
335 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3065  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.85 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.66 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.26 
 
 
324 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.41 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.55 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.74 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.64 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.89 
 
 
318 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  19.57 
 
 
365 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 
334 aa  70.5  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.74 
 
 
314 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.02 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.74 
 
 
329 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.9 
 
 
314 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.74 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.12 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.28 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.14 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.76 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.31 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3171  hypothetical protein  24.56 
 
 
482 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  22.71 
 
 
334 aa  67  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.78 
 
 
328 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  22.08 
 
 
329 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  23.83 
 
 
487 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.99 
 
 
488 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  24.19 
 
 
408 aa  66.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.43 
 
 
272 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.3 
 
 
601 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.7 
 
 
323 aa  66.6  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>