185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2750 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  100 
 
 
431 aa  864  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  64.58 
 
 
431 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  53.55 
 
 
417 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  50.58 
 
 
432 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  51.94 
 
 
417 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  52.83 
 
 
417 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  45.37 
 
 
411 aa  313  5e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  42.76 
 
 
434 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  39.54 
 
 
417 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  38.98 
 
 
414 aa  292  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  39.58 
 
 
438 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  39.58 
 
 
438 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  39.58 
 
 
438 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  39.58 
 
 
438 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  39.58 
 
 
438 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  39.25 
 
 
438 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  41.83 
 
 
433 aa  288  9e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  39.9 
 
 
438 aa  283  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  39.39 
 
 
438 aa  283  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  39.9 
 
 
438 aa  283  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  39.9 
 
 
438 aa  283  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  39.9 
 
 
438 aa  283  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  39.14 
 
 
412 aa  282  7e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  40.29 
 
 
428 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  37.56 
 
 
413 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  39.91 
 
 
409 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  39.18 
 
 
420 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  41.65 
 
 
426 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  41.9 
 
 
426 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  37.8 
 
 
436 aa  275  1e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  39.57 
 
 
435 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  41.94 
 
 
427 aa  272  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  37.8 
 
 
457 aa  269  6e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  37.76 
 
 
424 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  39.91 
 
 
437 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  37.29 
 
 
457 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 
423 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  39.13 
 
 
423 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 
423 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 
423 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 
423 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  36.67 
 
 
457 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  36.67 
 
 
457 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  36.89 
 
 
420 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  35.32 
 
 
443 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  38.97 
 
 
424 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  38.1 
 
 
423 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  38.1 
 
 
423 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  36.43 
 
 
415 aa  254  1e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  37.79 
 
 
421 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  39.31 
 
 
407 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  38.33 
 
 
423 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  38.11 
 
 
410 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  37.28 
 
 
415 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  36.88 
 
 
435 aa  245  1e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  36.65 
 
 
399 aa  243  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  35.96 
 
 
434 aa  240  3e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  37.03 
 
 
415 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  37.59 
 
 
421 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  36.39 
 
 
425 aa  235  1e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  39.16 
 
 
436 aa  235  1e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  37.75 
 
 
431 aa  234  2e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  37.75 
 
 
431 aa  233  4e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  37.25 
 
 
428 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  37.5 
 
 
431 aa  232  8e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.54879e-05  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  32.96 
 
 
440 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  36.05 
 
 
389 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  34.64 
 
 
448 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  30.9 
 
 
430 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  34.05 
 
 
418 aa  223  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  34.05 
 
 
418 aa  221  1e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  38.4 
 
 
435 aa  221  2e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  35.8 
 
 
425 aa  221  2e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  31.74 
 
 
474 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  36.34 
 
 
381 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  36.16 
 
 
403 aa  215  1e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 
419 aa  214  2e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.65 
 
 
428 aa  213  8e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 
412 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  33.06 
 
 
485 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  30.68 
 
 
444 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  34.96 
 
 
428 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  33.58 
 
 
442 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 
471 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
468 aa  201  2e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  34.92 
 
 
413 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  34.54 
 
 
405 aa  199  1e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  33.66 
 
 
429 aa  198  2e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  34.93 
 
 
412 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  34.45 
 
 
406 aa  196  5e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  32.33 
 
 
437 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  33.01 
 
 
413 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  31.8 
 
 
429 aa  189  6e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 
441 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  30.7 
 
 
448 aa  185  1e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 
439 aa  183  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  30.7 
 
 
424 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
438 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  33.67 
 
 
408 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.42276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.28 
 
 
443 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>