More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0388 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 740 aa  1529    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  46.5 
 
 		 794 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  42.8 
 
 		 762 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  46.19 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  43.59 
 
 		 772 aa  611  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  44.25 
 
 		 773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  43.72 
 
 		 786 aa  600  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  40.16 
 
 		 785 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  41.21 
 
 		 743 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  42.68 
 
 		 850 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  41.77 
 
 		 765 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  41.51 
 
 		 786 aa  541  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  42.84 
 
 		 767 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  40.7 
 
 		 854 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  38.01 
 
 		 815 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  38.88 
 
 		 776 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 		 774 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 760 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.24 
 
 		 752 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.84 
 
 		 730 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 		 762 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 750 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  38.17 
 
 		 783 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 		 810 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.04 
 
 		 907 aa  435  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 841 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 		 755 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  37.17 
 
 		 857 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 		 801 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 821 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  37.17 
 
 		 870 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  36.34 
 
 		 850 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 		 862 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 		 888 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.87 
 
 		 858 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.11 
 
 		 838 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  36.89 
 
 		 826 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 		 857 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 		 857 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 		 834 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 732 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 		 728 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 		 787 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 787 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 928 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 678 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  34.99 
 
 		 698 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.58 
 
 		 748 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.26 
 
 		 841 aa  296  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.3 
 
 		 796 aa  290  9e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 		 806 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.39 
 
 		 773 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.12 
 
 		 830 aa  277  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 		 831 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 831 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.24 
 
 		 818 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  29.53 
 
 		 808 aa  273  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.54 
 
 		 827 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 843 aa  272  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  28 
 
 		 797 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.08 
 
 		 792 aa  270  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  29.84 
 
 		 805 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 835 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.38 
 
 		 829 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 		 804 aa  267  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  29.83 
 
 		 830 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  29.28 
 
 		 830 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  28.49 
 
 		 823 aa  265  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 818 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 804 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  29.38 
 
 		 830 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.52 
 
 		 648 aa  263  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  29.23 
 
 		 805 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 713 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  28.96 
 
 		 805 aa  261  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  26.82 
 
 		 802 aa  261  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  29.36 
 
 		 833 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 810 aa  260  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  32.78 
 
 		 890 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 843 aa  260  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 847 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  28.93 
 
 		 791 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 		 855 aa  257  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  28.83 
 
 		 791 aa  257  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>