More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1589 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  778  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  80.49 
 
 
398 aa  582  1e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  82.79 
 
 
398 aa  581  1e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  70.03 
 
 
404 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  66.93 
 
 
404 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  67.19 
 
 
405 aa  493  1e-138  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  67.46 
 
 
405 aa  493  1e-138  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  66.58 
 
 
405 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  66.58 
 
 
405 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  66.31 
 
 
405 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  65.31 
 
 
400 aa  469  1e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  65.04 
 
 
400 aa  468  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  65.04 
 
 
400 aa  467  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  67.04 
 
 
405 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  69.39 
 
 
388 aa  461  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  67.54 
 
 
399 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  67.01 
 
 
399 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  66.75 
 
 
399 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  63.54 
 
 
401 aa  418  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  61.81 
 
 
400 aa  407  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  69.04 
 
 
402 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  61.86 
 
 
399 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50.52 
 
 
393 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  52.39 
 
 
401 aa  326  4e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  47.37 
 
 
389 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  47.37 
 
 
389 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  50.94 
 
 
398 aa  322  1e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  50.28 
 
 
396 aa  321  1e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 
402 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  46.79 
 
 
406 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 
402 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  45.85 
 
 
407 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  48.44 
 
 
413 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 
447 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  38.86 
 
 
392 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  51.74 
 
 
408 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  43.01 
 
 
405 aa  275  1e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  38.52 
 
 
406 aa  272  8e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  38.52 
 
 
406 aa  272  8e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  38.52 
 
 
403 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.11 
 
 
394 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.74 
 
 
399 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 
413 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.44 
 
 
409 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.8 
 
 
399 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.92 
 
 
416 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.87 
 
 
399 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.37 
 
 
385 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.28 
 
 
399 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.28 
 
 
399 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.28 
 
 
399 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
397 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.57 
 
 
394 aa  232  8e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.38 
 
 
405 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.16 
 
 
394 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.16 
 
 
394 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.16 
 
 
394 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.16 
 
 
394 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.31 
 
 
394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
394 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
394 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.11 
 
 
389 aa  223  5e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
394 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  41.45 
 
 
433 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.8 
 
 
403 aa  222  1e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.64 
 
 
394 aa  221  2e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
389 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.79 
 
 
394 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.16 
 
 
394 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 
410 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  39.61 
 
 
383 aa  216  6e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.83 
 
 
395 aa  216  6e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
415 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
406 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
406 aa  214  1e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  42.67 
 
 
431 aa  213  3e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
387 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  42.26 
 
 
427 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
399 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  38.11 
 
 
415 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.8 
 
 
399 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  44.41 
 
 
427 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
391 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
419 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  37.63 
 
 
403 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.11 
 
 
422 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  44.41 
 
 
427 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.48 
 
 
426 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  44.41 
 
 
427 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.17 
 
 
390 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.44 
 
 
411 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  40.06 
 
 
391 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.37 
 
 
399 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.37 
 
 
405 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
413 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.37 
 
 
399 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.37 
 
 
399 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.37 
 
 
399 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.37 
 
 
399 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>