61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2449 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  100 
 
 
411 aa  788    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  51.66 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  50.36 
 
 
409 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  32.62 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.32 
 
 
397 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  41.18 
 
 
180 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  33.06 
 
 
681 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  21.96 
 
 
458 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  35.91 
 
 
554 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  35.75 
 
 
777 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  32.09 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  36.25 
 
 
541 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  36.26 
 
 
645 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  31.1 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  32.67 
 
 
580 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  21.77 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  37.25 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  30.61 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  27.85 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  30.22 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  32.35 
 
 
485 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  31.87 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  29.14 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  26.78 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  37.9 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  29.83 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  29.83 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  31.72 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  31.72 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  29.83 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  29.83 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  37.9 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  31.72 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  31.31 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  34.44 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  26.63 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  34.04 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  35.64 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  26.15 
 
 
504 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  22.73 
 
 
497 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.72 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  32.37 
 
 
1488 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  34.52 
 
 
108 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  24.94 
 
 
436 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.71 
 
 
838 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  34.38 
 
 
144 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
252 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.51 
 
 
1888 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 
851 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.22 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.37 
 
 
851 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  31.43 
 
 
1481 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  50 
 
 
933 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.73 
 
 
557 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.28 
 
 
856 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  27.33 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0513  FHA domain-containing protein  33.91 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  33.77 
 
 
566 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  26.06 
 
 
438 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  26.06 
 
 
438 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>