72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2320 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 480 aa  963    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  62.48 
 
 		 508 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  75.56 
 
 		 180 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  59.33 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  35.44 
 
 		 463 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  29.67 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  31.19 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  31.22 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  46.11 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  25.37 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  38.76 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  38.97 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  36.27 
 
 		 645 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  38.25 
 
 		 681 aa  130  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  38.33 
 
 		 777 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  34.21 
 
 		 604 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  33.22 
 
 		 565 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  30.23 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  30.23 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  30.23 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  35.52 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  31.19 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  39.35 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  21.84 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  33.82 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  31.4 
 
 		 453 aa  94.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  35.48 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  28.97 
 
 		 572 aa  90.5  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  39.82 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  24.51 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  21.6 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  27.03 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  38.74 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  22.45 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  27.57 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  28.12 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  21.81 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  25.29 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  25.29 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  27.03 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  23.41 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  23.41 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  23.41 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  24.08 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  24.08 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  31.19 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  22.28 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  22.72 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  36.14 
 
 		 225 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0481  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  36.99 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.73 
 
 		 2449 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.14 
 
 		 1888 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  38.3 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  38.96 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  34.18 
 
 		 1157 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  35.79 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37 
 
 		 899 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0021  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0029  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  hitchhiker  0.00992871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0021  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  35.42 
 
 		 863 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36 
 
 		 903 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0806  FHA domain-containing protein  34.91 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  32.53 
 
 		 225 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>