37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3841 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  100 
 
 
681 aa  1342    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
777 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  43.59 
 
 
554 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  42.19 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  40.31 
 
 
478 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  40.31 
 
 
478 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  40.31 
 
 
478 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  40.31 
 
 
478 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 
477 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
460 aa  140  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  39.38 
 
 
485 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  40.47 
 
 
580 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  36.92 
 
 
604 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  37.5 
 
 
508 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  37.5 
 
 
565 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
480 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  38.92 
 
 
572 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  39.13 
 
 
180 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  34.39 
 
 
411 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  34.54 
 
 
409 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  34.54 
 
 
409 aa  94  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 
458 aa  94  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  29.73 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  25.13 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  30.57 
 
 
470 aa  79  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  31.05 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  29.26 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  27.69 
 
 
453 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  29.3 
 
 
397 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  29.3 
 
 
400 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  33.11 
 
 
398 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  32.64 
 
 
398 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  32.87 
 
 
397 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  33.66 
 
 
433 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  29.41 
 
 
398 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>