47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0318 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  99.77 
 
 
438 aa  905    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  45.48 
 
 
426 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  45.25 
 
 
426 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  45.25 
 
 
426 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  45.43 
 
 
428 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  45.43 
 
 
428 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  41.06 
 
 
409 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  40.89 
 
 
406 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  39.86 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  36.87 
 
 
436 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  36.03 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  45.69 
 
 
503 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  46.35 
 
 
495 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  21.21 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  25.29 
 
 
480 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  33.06 
 
 
189 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  32.26 
 
 
189 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  23.64 
 
 
508 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  24.24 
 
 
180 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  26.6 
 
 
236 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  23.27 
 
 
470 aa  53.5  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  30.86 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  30.86 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  25.77 
 
 
645 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  29.27 
 
 
397 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  23.2 
 
 
189 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  29.27 
 
 
485 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  26.52 
 
 
572 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  25.66 
 
 
463 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  26.63 
 
 
604 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  22.54 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  27.87 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  25.52 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  27.87 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  22.86 
 
 
554 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  28.23 
 
 
398 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  26.06 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  24.24 
 
 
565 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  21.97 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  26.19 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>