57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2377 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  100 
 
 
458 aa  946    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  30.33 
 
 
397 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  25.27 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  25.44 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  24.89 
 
 
400 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  25 
 
 
398 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  25.05 
 
 
397 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  34.24 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  32.07 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  24.6 
 
 
453 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  29.41 
 
 
565 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  23.44 
 
 
409 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  50 
 
 
108 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  24.35 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  31.1 
 
 
180 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  30.37 
 
 
645 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  29.38 
 
 
580 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  22.99 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  28.04 
 
 
478 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  28.04 
 
 
478 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  28.04 
 
 
477 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  30.62 
 
 
681 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  27.72 
 
 
460 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  28.23 
 
 
485 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  32.93 
 
 
463 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  26.84 
 
 
554 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  31.06 
 
 
470 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  24.22 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  26.06 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  30.32 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  23.46 
 
 
604 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  36.79 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  28.28 
 
 
777 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  28.32 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  22.29 
 
 
495 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  22.34 
 
 
572 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  33.7 
 
 
497 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  22.4 
 
 
436 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  25.26 
 
 
424 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  40.24 
 
 
134 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  20.23 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  20.47 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  19.64 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  19.64 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  38.81 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  19.64 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  22.04 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  30.14 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  45.71 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  35.87 
 
 
220 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
153 aa  43.9  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  50 
 
 
269 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  34.21 
 
 
236 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>