75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00253 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  100 
 
 
470 aa  927    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  38.75 
 
 
508 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  26.97 
 
 
458 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  37.02 
 
 
554 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  39.18 
 
 
580 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  36.88 
 
 
180 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  36.54 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  36.54 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  41.84 
 
 
409 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  41.13 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  32.72 
 
 
645 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  29.34 
 
 
565 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  26.21 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  26.26 
 
 
477 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  26.21 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  26.21 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  26.21 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  40.27 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  39.33 
 
 
398 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  26 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
478 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  39.26 
 
 
463 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  33.65 
 
 
398 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  28.27 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  28.31 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  27.22 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  31.54 
 
 
777 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  28.37 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  27.81 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  30.41 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  35.78 
 
 
453 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  25.6 
 
 
572 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  31.93 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  31.87 
 
 
541 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  20.57 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  20.57 
 
 
438 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  27.54 
 
 
406 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  32.56 
 
 
424 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.09 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  31.19 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  27.54 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  32 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  25.36 
 
 
495 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  33.04 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  35.58 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4988  FHA domain-containing protein  45 
 
 
333 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0221  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
110 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  32.22 
 
 
236 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3161  FHA domain-containing protein  45.31 
 
 
333 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5719  FHA domain-containing protein  43.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225135  normal  0.254458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3131  FHA domain-containing protein  43.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4508  FHA domain-containing protein  43.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5140  FHA domain-containing protein  43.33 
 
 
333 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  22.73 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  34.78 
 
 
419 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  38.95 
 
 
533 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  20.8 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  30.33 
 
 
634 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  22.7 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  22.7 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  22.7 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  31.17 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  41.43 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3824  FHA domain containing protein  36.59 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  37.1 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  45.83 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.48 
 
 
890 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  22.7 
 
 
428 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  22.7 
 
 
428 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
237 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.16 
 
 
863 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  34.09 
 
 
770 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  32.77 
 
 
1057 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>