29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6044 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  100 
 
 
419 aa  851    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  34.31 
 
 
504 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  42.19 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  32.02 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  32.67 
 
 
497 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  31.46 
 
 
319 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  42.11 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  39.24 
 
 
252 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  31.71 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 
409 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  30.59 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  33.02 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
433 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  34.88 
 
 
541 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  27.93 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  41.03 
 
 
181 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  32.89 
 
 
453 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  36.36 
 
 
770 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  25 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  23.64 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  31.73 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  38.81 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  38.1 
 
 
164 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  37.31 
 
 
173 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  34.67 
 
 
566 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  46.67 
 
 
302 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  34.33 
 
 
400 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>