57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5581 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  80.65 
 
 
398 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  64.57 
 
 
397 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  66.92 
 
 
398 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  64.34 
 
 
400 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  33.18 
 
 
453 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  25.49 
 
 
458 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  29.32 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  37.99 
 
 
480 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  28.8 
 
 
409 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.69 
 
 
397 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  36.08 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  36.54 
 
 
180 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  39.35 
 
 
470 aa  94  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  30.41 
 
 
580 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  26.19 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  26.72 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  34.26 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  25.24 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  32.91 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  31.46 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  25.96 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  32.34 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  30.67 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  29.26 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  22.27 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  28.85 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  21.91 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  22.43 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  21.81 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  22.43 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  29.02 
 
 
477 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  29.02 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  29.02 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  28.5 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  32.47 
 
 
681 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  28.5 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  28.5 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  28.5 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  28.5 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  31.72 
 
 
777 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  29.23 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  30.25 
 
 
645 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1139  hypothetical protein  34.57 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.49 
 
 
497 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  27.96 
 
 
504 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  23.9 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  23.9 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  26.24 
 
 
604 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  25.14 
 
 
503 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  28.26 
 
 
108 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  34.09 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  27.95 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  25.14 
 
 
424 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  23.64 
 
 
419 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  25 
 
 
495 aa  46.6  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>