68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05854 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  68.62 
 
 
497 aa  712    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1045    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  39.76 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  34.86 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  35.23 
 
 
541 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  36.04 
 
 
480 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  34.31 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  39.76 
 
 
314 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  35.92 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
433 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  33.73 
 
 
508 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  32.61 
 
 
398 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  27.98 
 
 
453 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
398 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  33.73 
 
 
319 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  32.1 
 
 
397 aa  57  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  26.72 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
236 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  32.05 
 
 
400 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  32.05 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  22.28 
 
 
458 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  34.65 
 
 
137 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  39.19 
 
 
269 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  36.11 
 
 
145 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.24 
 
 
899 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  40.58 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.99 
 
 
903 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  36.49 
 
 
158 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
310 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  35.21 
 
 
149 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  36.11 
 
 
134 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  43.75 
 
 
475 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  39.02 
 
 
245 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3726  forkhead-associated  40.91 
 
 
318 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  28.57 
 
 
554 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  21.73 
 
 
495 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  39.71 
 
 
169 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  36.62 
 
 
108 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.67 
 
 
684 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.34 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000961656  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  29.51 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.75 
 
 
554 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  32.41 
 
 
225 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2735  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
213 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285351  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  31.17 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  34.15 
 
 
237 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
155 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  35.23 
 
 
1108 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.75 
 
 
554 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  42.19 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  32.22 
 
 
252 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  39.71 
 
 
253 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3184  FHA domain containing protein  38.81 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148023  normal  0.306056 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  35.82 
 
 
137 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  40.28 
 
 
211 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92878  predicted protein  35.71 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1562  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  40.28 
 
 
211 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  40.62 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.11 
 
 
238 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.75 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  37.66 
 
 
224 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  34.67 
 
 
178 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30 
 
 
557 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  31.96 
 
 
137 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  32 
 
 
252 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.77 
 
 
1004 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  34.15 
 
 
188 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>