43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0208 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  100 
 
 		 645 aa  1238    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 477 aa  200  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  45.39 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  45.02 
 
 		 478 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  48.85 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  45.02 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  50 
 
 		 485 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  46.46 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  42.21 
 
 		 554 aa  160  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  41.75 
 
 		 580 aa  137  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  39.29 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  36.87 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  33 
 
 		 409 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  27.4 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  33.57 
 
 		 409 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 541 aa  98.6  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  33.45 
 
 		 463 aa  92  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  36.26 
 
 		 411 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  31.28 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  39.13 
 
 		 604 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.1 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  36.89 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  40.21 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  25.55 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  28.93 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  28.93 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  37.89 
 
 		 777 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 		 398 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  25 
 
 		 409 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  27.62 
 
 		 436 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  29.87 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  23.71 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  25.86 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  32.74 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  29.14 
 
 		 398 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  26.44 
 
 		 406 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  26.38 
 
 		 438 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  26.38 
 
 		 438 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>