51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0544 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  100 
 
 		 554 aa  1082    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  47.95 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  42.99 
 
 		 681 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  36.05 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  46.11 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  43.75 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  40.09 
 
 		 777 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  45.51 
 
 		 180 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  39.62 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  40.49 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  39.88 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  37.57 
 
 		 463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 409 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  35.71 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  37.42 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  32.88 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  35.21 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  25.98 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  31.72 
 
 		 541 aa  93.6  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  25.79 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  31.49 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  28.64 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  30.38 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  29.55 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  27.52 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  33.12 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  31.33 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  37.66 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  40.86 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  28.42 
 
 		 108 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  24.31 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 		 174 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  21.43 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  24.42 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.71 
 
 		 1004 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  28.36 
 
 		 189 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  44.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  27.36 
 
 		 694 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  22.86 
 
 		 438 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  22.86 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>