46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2456 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  100 
 
 
604 aa  1224    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  76.39 
 
 
572 aa  337  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  49.49 
 
 
485 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  50 
 
 
478 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  50 
 
 
478 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  50 
 
 
478 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  50 
 
 
478 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  50.52 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  50 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  50.52 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  50 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  44.7 
 
 
565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  42.49 
 
 
554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  41.21 
 
 
777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  36.92 
 
 
681 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  37.1 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  35.18 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  35.23 
 
 
480 aa  113  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  35.8 
 
 
180 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  28.36 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  27.22 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  30.81 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  30.27 
 
 
409 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  23.77 
 
 
397 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  30.22 
 
 
411 aa  79  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  27.61 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  26.9 
 
 
541 aa  77  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  23.46 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
645 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  30.67 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  27.89 
 
 
400 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  27.89 
 
 
397 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  28.66 
 
 
397 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  29.19 
 
 
398 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  37.5 
 
 
314 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  25.77 
 
 
436 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  23.5 
 
 
453 aa  47.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  26.63 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  26.63 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  28.21 
 
 
398 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  36.84 
 
 
319 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.98 
 
 
409 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  24.07 
 
 
406 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  25.93 
 
 
406 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1130  FHA domain-containing protein  39.47 
 
 
146 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.322041  normal  0.523828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>