32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1179 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  100 
 
 		 314 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  42.17 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  39.76 
 
 		 504 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  32.31 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  35.53 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  32.67 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  33.98 
 
 		 463 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  37.5 
 
 		 604 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  37.68 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  32.28 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  33.77 
 
 		 495 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  31.53 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  39.06 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1797  FHA domain containing protein  36.26 
 
 		 195 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  34.38 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  36.89 
 
 		 152 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  33.75 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44 
 
 		 799 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  32.5 
 
 		 453 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  29.59 
 
 		 508 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.67 
 
 		 799 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  42.7  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  29.59 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 		 480 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  41.43 
 
 		 162 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>