36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0026 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1029    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  41.86 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  40.34 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  33.8 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  48.21 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  48.21 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  48.21 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  46.67 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  46.67 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  40.96 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  46.35 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  47.87 
 
 		 406 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  46.35 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  47.87 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  33.15 
 
 		 236 aa  86.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  38.18 
 
 		 189 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  38.18 
 
 		 189 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  35.04 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  22.29 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  21.88 
 
 		 508 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  26.52 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  28.11 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  27.16 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  29.46 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  27.01 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  21.57 
 
 		 180 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  28.3 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  27.69 
 
 		 398 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  26.02 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  33.77 
 
 		 314 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  30.97 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  33.05 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  31.94 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  21.3 
 
 		 580 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  25.38 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>