50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2162 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  786    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  65.44 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  57.29 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  55.52 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  55.52 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  63.64 
 
 		 114 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  22.5 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  27.96 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  26 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  21.48 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.37 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  30 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 424 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  28.95 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 383 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 525 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.24 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  25.9 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 464 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>