More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0881 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  800    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  43.17 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 449 aa  155  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  27.19 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  28.46 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.76 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  26.79 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.79 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  27.02 
 
 		 895 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  26.2 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  25 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  27.46 
 
 		 905 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  27.19 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  25 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  29.09 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  24.73 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.01 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  29.1 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  24.73 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 424 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  25.63 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.31 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.59 
 
 		 912 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.47 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.08 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  24.83 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.14 
 
 		 893 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.16 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  26.16 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.16 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.16 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.16 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  27.09 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  26.95 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.98 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  29.2 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.19 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 491 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  24.82 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  25 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>