More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1890 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 574 aa  1160    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.11 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.17 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.35 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  49.35 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.37 
 
 		 586 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.83 
 
 		 573 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.3 
 
 		 573 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.16 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.21 
 
 		 885 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.2 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.29 
 
 		 907 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  42.42 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.74 
 
 		 811 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.56 
 
 		 814 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.79 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.55 
 
 		 827 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.04 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.96 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  37.57 
 
 		 574 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.66 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.05 
 
 		 773 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.72 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.19 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.96 
 
 		 567 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.51 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 779 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.05 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.51 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.66 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.58 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  36.19 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.81 
 
 		 779 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.81 
 
 		 779 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.64 
 
 		 779 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.64 
 
 		 779 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.5 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 		 584 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.46 
 
 		 779 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.36 
 
 		 584 aa  358  9.999999999999999e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.89 
 
 		 589 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.23 
 
 		 798 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 574 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 788 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 785 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.41 
 
 		 610 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 571 aa  353  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.45 
 
 		 846 aa  353  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.87 
 
 		 732 aa  352  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 572 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  40 
 
 		 932 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 		 564 aa  350  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.02 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.04 
 
 		 579 aa  349  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 		 989 aa  349  7e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.51 
 
 		 577 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.19 
 
 		 572 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  34.95 
 
 		 568 aa  346  6e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.74 
 
 		 801 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  34.32 
 
 		 566 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.37 
 
 		 865 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.01 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.66 
 
 		 566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40 
 
 		 573 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.56 
 
 		 583 aa  340  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.48 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.7 
 
 		 756 aa  339  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 		 831 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.87 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.55 
 
 		 626 aa  335  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  35.68 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  39.61 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  35.69 
 
 		 571 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  38.58 
 
 		 606 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  40.11 
 
 		 577 aa  330  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  40.53 
 
 		 577 aa  329  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  40.11 
 
 		 577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  40.11 
 
 		 577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.06 
 
 		 757 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.06 
 
 		 757 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  40.11 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.86 
 
 		 911 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.33 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  39.93 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.74 
 
 		 577 aa  327  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  39.93 
 
 		 577 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.34 
 
 		 955 aa  326  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  40.04 
 
 		 577 aa  326  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  39.74 
 
 		 577 aa  326  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 654 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  39.55 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.39 
 
 		 566 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  39.55 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  39.55 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.08 
 
 		 569 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  39.55 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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