59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0733 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  928    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  26.7 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  23.08 
 
 		 532 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  34.95 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  41.46 
 
 		 176 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  23.03 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.95 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.66 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  36.57 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  26.29 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.47 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  30.56 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  32.81 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  32.73 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  35.29 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.06 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  27.89 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  27.12 
 
 		 530 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  40.26 
 
 		 336 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  28.78 
 
 		 251 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  32.56 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  38.46 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  24.1 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  23.84 
 
 		 571 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  39.51 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  43.06 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 556 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  28.81 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  30.58 
 
 		 567 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  31.97 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  23.49 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  25.41 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  25.88 
 
 		 540 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  26.28 
 
 		 976 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  24.79 
 
 		 619 aa  47  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  36 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  28.1 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.29 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  32.14 
 
 		 697 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  25.44 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  25.2 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  34.25 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  39.06 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  25.66 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  35.14 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.62 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  23.45 
 
 		 352 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  40.91 
 
 		 533 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  34.29 
 
 		 284 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.93 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  32.95 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  32.95 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  26.96 
 
 		 509 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  34.62 
 
 		 339 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  26.09 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>