More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1652 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
616 aa  1265    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  70.16 
 
 
628 aa  885    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  59.68 
 
 
628 aa  762    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  66.12 
 
 
629 aa  824    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  64.45 
 
 
619 aa  823    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  63.2 
 
 
631 aa  810    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  65.13 
 
 
627 aa  820    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  50 
 
 
615 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.59 
 
 
607 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  42.95 
 
 
598 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  41.78 
 
 
597 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 
624 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  42.93 
 
 
599 aa  462  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  41.6 
 
 
596 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 
598 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  39.7 
 
 
602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 
596 aa  451  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.97 
 
 
603 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  43.09 
 
 
591 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.45 
 
 
622 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 
620 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 
620 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
594 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
594 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 
596 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
594 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 
594 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
594 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 
594 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
594 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  42.93 
 
 
610 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 
594 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 
588 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.95 
 
 
613 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.5 
 
 
601 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
594 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 
594 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 
590 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  38.37 
 
 
596 aa  429  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  39.75 
 
 
641 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 
625 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.36 
 
 
604 aa  425  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 
595 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  40.63 
 
 
593 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 
615 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 
616 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.48 
 
 
685 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 
656 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.69 
 
 
593 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  38.35 
 
 
649 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 
658 aa  413  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  41.02 
 
 
591 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  36.73 
 
 
615 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
610 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  37.37 
 
 
692 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.18 
 
 
653 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 
611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.12 
 
 
638 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
666 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 
594 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  38.39 
 
 
628 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  38.82 
 
 
675 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 
612 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.82 
 
 
671 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  39.56 
 
 
599 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 
678 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.43 
 
 
613 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 
613 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 
674 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 
624 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.12 
 
 
614 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 
658 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
669 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  37.2 
 
 
670 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 
607 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
593 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 
520 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 
676 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 
678 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 
593 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 
676 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.01 
 
 
607 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 
693 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 
676 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.12 
 
 
599 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 
646 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.85 
 
 
607 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 
613 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 
617 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 
627 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 
659 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
643 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 
705 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 
617 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 
622 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 
613 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 
626 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  36 
 
 
679 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.29 
 
 
594 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.23 
 
 
647 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>